רחובות הוקמה בזמן העלייה הראשונה כמושבה של עולים מפולין. העולים השתייכו לקבוצת "מנוחה ונחלה", ביניהם אהרון אייזנברג ובתיה מקוב. ההתיישבות בוצעה בשנת 1890 לאחר שקנתה החברה אדמות מבני הישוב הערבי "ח'ירבת- דוראן" ששכן במקום.
בשנת ההקמה ניטעו כרמים של ענבים אשר נמכרו ליקב ראשון לציון הסמוך. בשנת 1904 ניטעו במקום הפרדסים הראשונים אשר נתנו לה ברבות הימים את הכינוי "עיר ההדרים".
בשנת 1907 הגיעו למושבה עולים ראשונים מתימן, בייחוד מאזורי הערים חידאן וצעדה. העולים נקלטו מהר בגלל יכולתם לעבוד עבודה חקלאית ואף הקימו בעיר שלוש שכונות: שכונת התימנים, שכונת שעריים וכפר מרמורק.
ענף פרי ההדר התפתח בעיר, בייחוד לאחר הקמת תחנת רכבת בעיר בשנת 1920. בקרבת התחנה נבנו מספר בתי אריזה לפירות הדר מהם נשלחה הסחורה ברכבת לשאר חלקי הארץ, ולנמל יפו ומשם לייצוא לאירופה.
בשנת 1933 הוקם בעיר מפעל המיצים והמשקאות יפאורה.
רחובות הוכרזה כעיר בשנת 1950 כאשר היו בה מעל 18,000 תושבים.
כיום חיים 108,400 תושבים, למעלה מ-20% מתושבי העיר הם עולים אשר רובם ממדינות חבר העמים, אתיופיה ותימן.
השכלה גבוהה- ברחובות שוכנים שני מוסדות להשכלה גבוהה ומחקר עיקריים: מכון ויצמן למדע שהוקם בשנת 1934 והפקולטה לחקלאות של האוניברסיטה העברית. כיום פועלות בעיר מספר מכללות: "המכללה העירונית לחינוך מבוגרים", מכללת "אורט רחובות", "מכללת רחובות", "המרכז האקדמי פרס" וכן המכללה הדתית למורים"מורשת יעקב ".
מפעלים ומוסדות ברחובות- ברחובות נמצא המרכז הרפואי "קפלן" המשרת ערים שכנות כמו אשדוד, גדרה, יבנה ונס ציונה.
בעיר מפעלי תעשיה אחדים, שהבולטים בהם הם מחלבת תנובה ומפעל המיצים והמשקאות יפאורה תבורי. כמו כן, בעשור האחרון התפתח בסמוך לרחובות פארק תעשיות עתירות ידע, הוא "פארק ת.מ.ר ע"ש יצחק רבין" (פארק המדע - תעשיות מדע רחובות). בפארק המדע ניתן למצוא כמה מהחברות המובילות ביותר בתעשיית ההיי-טק הישראלי.
בעבר הייתה ידועה עירנו בפרדסים הרבים אשר היו בשטחה, אך כיום אין בשטח העיר חקלאות הדרים פעילה והפרדסים הנטושים הולכים ונמחקים על ידי הבנייה החדשה.
